| 99000 | Beleña Fresnillo Centro | Urbano | 14,590 |
| 99010 | Emiliano Zapata Lomas del Mineral Napoleón Gómez Sada Privada Lomas del Mineral Solidaridad | Urbano | 9,872 |
| 99011 | Lomas de Plateros | Urbano | 3,333 |
| 99013 | México Plutarco Elias Calles Sector Popular | Urbano | 5,087 |
| 99014 | Alianza Ciudadana Ampliación Azteca Azteca Colinas del Real Europa Francisco I Madero Lázaro Cárdenas Nueva Esperanza Panamericana Patria y Libertad Plan de Ayala | Urbano | 10,349 |
| 99020 | Benito Juárez El Fresno Francisco Goytia INFONAVIT Magisterial Tecnológica | Urbano | 4,720 |
| 99030 | El Parque Industrial Las Américas | Urbano | 9,007 |
| 99034 | Bajío de Fresnillo Ejidal 3 La Joya Las Torcazas Lienzo Charro Los Artesanos Miguel Hidalgo Progreso | Urbano | 7,118 |
| 99039 | Lindavista Universidad | Urbano | 1,380 |
| 99040 | Del Policía José María Vázquez Lasalle Periodistas | Urbano | 1,449 |
| 99049 | 18 de Julio Indeco | Urbano | 447 |
| 99050 | Del Fresno Jardin de las Flores Jesús González Ortega Las Flores Luis Donaldo Colosio Obrera Norte | Urbano | 6,612 |
| 99054 | Ecología Francisco Villa Huertas de Abajo Las Haciendas | Urbano | 7,680 |
| 99055 | Del Sol Juan Antonio Casas Torres Satélite | Urbano | 2,068 |
| 99056 | 97 Batallón de Infantería Arboledas Felipe Ángeles Felipe Monreal Los Balcones Parque Industrial Fresnillo Real de Fresnillo Villas de Plateros | Urbano | 15,510 |
| 99060 | Lagunilla | Urbano | 1,315 |
| 99070 | Barrio Alto El Olivar Manuel M. Ponce | Urbano | 6,938 |
| 99080 | Buenos Aires El Vergel Esparza Fortuna FOVISSSTE Licenciado Roque Estrada La Paz Lomas de La Fortuna Real de Minas Ricardo Monreal Ávila Saucito | Urbano | 10,298 |
| 99084 | Del Valle Ejidal 4 Las Aves | Urbano | 5,182 |
| 99089 | Minera | Urbano | 1,123 |
| 99090 | Electricistas Insurgentes Maravillas Quinta del Cobre | Urbano | 2,641 |
| 99094 | Del Bosque Impresionistas Licenciado Abel Dávila García Los Olivos Magisterial Magisterio Unido Mesoamerica Muralista Polvaderas Providencia San Carlos Victoria | Urbano | 12,426 |
| 99095 | Los Chilitos Villas del Campestre | Mixto | — |
| 99099 | Arte Mexicano Jesús González Ortega Petróleos Mexicanos San Pedro Venustiano Carranza Villas Jardín | Urbano | 3,990 |
| 99150 | Benito Juárez El Pardillo Primero El Pardillo Segundo El Pardillo Tercero Estación San José Las Catarinas Las Tres Marías Miguel Hidalgo (Hidalgo) Morfín Chávez Palmira San Antonio de Buenavista San Felipe San Miguel de Sosa Santa Lucía Santiaguillo Valle de San Isidro (San Isidro) | Mixto | 8,018 |
| 99154 | Laguna Seca Orilla del Llano Santa Ana Santa Anita | Rural | — |
| 99155 | Los Pocitos Mendoza San José del Quelite San Miguel del Vergel | Rural | — |
| 99156 | Francisco García Salinas (La Larga) Presa del Mezquite (Tapias del Mezquite) San Tadeo | Rural | — |
| 99158 | Las Mercedes Ojo de Agua del Tule Plateros | Rural | 5,990 |
| 99159 | Chichimequillas Patillos Rafael Yáñez Sosa (El Mezquite) | Rural | — |
| 99160 | El Centro Felipe Ángeles (El Barranco) Francisco I Madero La Casita La Quemada (Francisco I. Madero) San Juan del Centro (El Porvenir del Centro) San Martín de los Pajaritos Urite Vasco de Quiroga Vicente Guerrero | Rural | — |
| 99165 | El Carrizalillo (Carrizalillo de Ábrego) | Rural | — |
| 99166 | Ermita de Guadalupe | Rural | — |
| 99170 | 6 de Enero Bañuelos (Bajío de Bañuelos) El Baluarte José María Morelos La Zanja Los Vergelitos Montemariana (Colonia Mariana) Río Florido San Ignacio | Mixto | 6,671 |
| 99174 | El Águila El Ahijadero Mesa de Tecolotillo | Rural | — |
| 99176 | Carrillo El Obligado Nuevo Zaragoza | Rural | — |
| 99177 | Tortuguillas (La Salud) | Rural | — |
| 99178 | La Cabaña (San Miguel del Alto) Los Álamos Plenitud San Vicente de Plenitud (San Vicente) | Rural | — |
| 99179 | El Epazote El Salto Emancipación Eréndira Melchor Ocampo (San Jerónimo) México Nuevo Uno (México Nuevo) San Cristóbal Tapias de Santa Cruz Torreón de los Pastores | Rural | — |
| 99180 | El Tigre (Los Nopales) Estación Gutiérrez Milpillas de la Sierra Redención | Rural | — |
| 99183 | La Encantada La Salada Plan de Vallecitos Puebla del Palmar (El Membrillo) | Rural | — |
| 99185 | Los Ángeles de los Medrano Ramón López Velarde (La Chicharrona) San Isidro del Cerro Gordo | Rural | — |
| 99188 | Altamira Emiliano Zapata (El Terreadero) Lázaro Cárdenas (Rancho Grande) Los Corrales (Emiliano Zapata) San Pablo de Rancho Grande | Mixto | 4,089 |
| 99189 | Bajío de San Gabriel Cieneguitas de Mariana Erendirilla Esparza La Manga Las Flores Loma Bonita San Gabriel San José de Lourdes Sector las Cumbres (Ejido Nuevo Zaragoza) | Mixto | 5,786 |
| 99190 | Agrícola Guanajuato Boca de Río Chico Guadalupe de Trujillo Matías Ramos Rincón de la Florida San Isidro de Cabrales San Isidro de Trujillo San Juan de los Hornillos San Miguel Santa Rosa | Rural | — |
| 99192 | Fernando Robles López Presa de Linares (Presa de Linares) Saucito del Poleo Valdecañas | Rural | — |
| 99193 | San José del Alamito | Rural | — |
| 99194 | Concepción Rivera Nuevo Día Providencia de Rivera (La Estanzuela) | Rural | — |
| 99195 | La Luz Las Piedras Modelo Órganos Purísima del Maguey | Rural | — |
| 99196 | Refugio de Santa Rosa (El Refugio) | Rural | — |
| 99198 | La Soledad Labor de Santa Bárbara San Pablo de los Puertos Sombreretillo | Rural | — |
| 99199 | Buenavista de Trujillo El Refugio de Ábrego (Benito Juárez) El Salitrillo El Tejuján La Cantera Presa Leobardo Reynoso (Primero de Mayo) San José del Río San Juan de la Casimira San Marcos de Ábrego San Pedro de Ábrego Trujillo | Rural | — |